基因组学课程共36学时, 以任课教师编写的由高等教育出版社2019年出版的”基因组学”(第4版)一书为教材. 全部课程按网上公布的教学大纲为主线展开。本课程共分三大部分内容, 分为14章, 第1章至第5章主要涉及基因组的结构, 重点介绍基因组遗传图和物理图绘制的原理和方法以及全基因组测序的策略,路线和方法. 第6章至第10章着重介绍基因组的功能, 包括基因水平, 染色质水平及基因组水平基因的表达与调控. 第11章至第14章讲述基因组的进化, 内容涉及基因组进化的分子机制以及进化的模式与生物多样性的关系。
基因组学研究的迅速发展不仅深化了我们原有对生命现象机理的解释与阐述, 而且提出了许多以往未曾预料的新的概念, 并形成了一套特有的研究思路、原理、技术与方法,本课程对上述内容进行了详细的介绍与讨论。鉴于基因组学这一新兴学科具有发展迅速, 未知领域多, 概念更新快的特点, 在许多章节对目前仍在争论以及尚无定论的科学问题在讲授时将点明问题所在, 使学生能动态地观测和思考基因组学的研究现状和前沿领域。
让学生了解与掌握结构基因组学和功能基因组学的基本知识,原理和方法,深入了解与熟悉基因组学领域的最新进展及其对生命科学各领域的影响,如何从本质上理解生命的起源,变异与进化。对理解当代生命科学中诸多极具突破性的技术革新和方法革新的理论基础有重要的指导性意义。
绪论
1-基因组学-基因组计划缘起
2-基因组学-基因组学重要进展
第1章 基因组
3-第1章 基因组 1 DNA RNA 蛋白质
4-第1章 基因组 2 基因组结构特征
第2章 遗传图绘制
5-第2章 遗传图绘制
第3章 物理图绘制
6-第3章 物理图绘制
第4章 基因组测序
7-第4章-1 基因组测序技术
8-第4章-2 全基因组测序
第5章 基因组注释
9-第5章-1 基因组注释-信息分析
10-第5章-2 基因组注释-实验验证
11-第5章-3 基因组编辑
第6章 基因组解剖
12-第6章 基因组解剖 1 真核生物基因组
13-第6章 基因组解剖 2 原核生物及细胞器基因组
第7章 基因的转录调控
14-第7章 基因的转录调控-PolI-PolIII
15-第7章 基因的转录调控-PolII
第8章 转录物组(上)
16-第08章 转录物组-组成与加工
17-第08章 转录物组-定位与降解
第8章 转录物组(下)
18-第8章 转录物组-miRNA
19-第8章 转录物组-siRNA
20-第8章 lncRNA
第9章 蛋白质组(上)
21-第9章 蛋白质组-翻译调控
第9章 蛋白质组(下)
22-第9章 蛋白质组-折叠与降解
第10章 基因组表观遗传(上)
23-第10章 基因组表观遗传-表观遗传现象
24-第10章 基因组表观遗传-DNA甲基化
第10章 基因组表观遗传(下)
25-第10章 基因组表观遗传-组蛋白甲基化
26-第10章 基因组表观遗传-组蛋白乙酰化
第11章 基因组的复制
27-第11章 基因组的复制-原核生物
28-第11章 基因组的复制-真核生物
第12章 基因组进化的机制
29-第12章 基因组进化的机制-突变与修复
30-第12章 基因组进化的机制-重组与转座
第13章 基因组进化的模式
31-第13章 基因组进化的模式-基因组水平的进化
32-第13章 基因组进化的模式-基因水平的进化(2)
第14章 基因组与生物进化(内附课程三部分作业测试)
33-第14章 基因组与生物进化
基因组学第三部分测试题
基因组学第一部分测试题
基因组学第二部分测试题
具备基础的生化知识、遗传学知识
高等教育出版社出版的《基因组学》第3版或者第4版,杨金水编著。