化学信息学(chemoinformatics) 是化学领域中近年来发展迅速的一个新的分支,主要是利用计算机技术和计算机网络技术,对化学信息进行表示、管理、分析、模拟和传播。本课程是化学信息学的入门课程,强调实践与应用,课程建立在学生的大量实践基础上。通过本课程的学习,了解化学信息学的基本概念,了解网上国际和国内重要的科技与化学信息源,了解与化学化工类有关行业的动态与发展;掌握通过计算机网络查找和收集化学信息的技能,熟悉化学及相关学科大型文献数据库的使用;熟悉现代化学图文处理软件、科学数据处理软件的使用方法与技术;了解一些分子与材料建模软件及其使用等。
1、了解化学信息学的基本概念; 2、掌握通过网络查找和收集化学信息的技能 3、掌握现代化学图文数据处理软件的使用技术; 4、了解有信息素养的人应该具有的能力,逐步提高信息素养。
60分以上 合格证书;
85分以上 优秀证书。
单元作业10%;
单元测验 30%;
期末考试30%;
课程讨论占30%,课程讨论限定在讨论区【课堂交流区】板块,发帖(或回帖)3个及以上为满分。其中,单元作业采用互评的,提交作业后才能参加互评,作业互评最少个数为6个;未参与互评得分为50%比例;未完成互评为80%;全部完成互评为100%。
一. 课程基本情况
课程中文名称 化学信息学 课程英文名称 Chemoinformatics
开课学院 化生学院 学时/学分 36/2
课程代码 0522334 授课对象 ■学硕 □专硕□博士
二. 教学的目的与要求
《化学信息学》课程是为化学专业全体研究生开设的一门学位必修课。课程的定位是为培养化学类专业研究型人才提升信息素养。通过本课程的学习,了解化学信息学的基本概念,熟练掌握通过Internet 和专业数据库查找和收集各类化学信息的方法;熟悉ChemOffice等现代化学图文处理软件的使用技术,掌握利用Origin软件进行科学数据处理的方法与技术;了解一些基本的量子力学和量子化学计算方法,进行化学建模、分子设计、分子的电子结构及相关性质的计算等;拓宽学生的知识面,加强综合能力的培养,培养“通才”,增强学生适应社会需求的能力。
三. 教学日历
周次 | 课次 | 学时数 | 教学方式 | 教 学 内 容 | 备 注 |
2 | 1 | 2 | 面授 | 课程导论 |
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计算机技术在化学中的应用 |
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2 | 2 | 面授 | 网络化学资源 |
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化学软件资源 |
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3 | 3 | 2 | 面授 | 科技文献检索 |
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重要中文文献数据库简介 |
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CNKI数据库的介绍与使用 |
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4 | 2 | 面授 | 重要外文全文数据库 |
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外文全文数据库检索 |
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外文文摘索引数据库 |
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4 | 5 | 2 | 线上 | Scifinder简介与注册 |
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Scifinder基本功能 |
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6 | 2 | 线上 | Scifinder案例介绍 |
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5 | 7 | 2 | 线上 | 专利数据库 |
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化学事实数据库 |
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学位论文数据库 |
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8 | 2 | 面授 | 化学外文文献检索 |
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案例分析 |
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6 | 9 | 2 | 线上 | 文献的规范化引用 |
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文献管理软件Endnote |
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10 | 2 | 线上 | ChemBioOffice介绍与使用 |
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7 | 11 | 2 | 线上 | ChemBio3D的介绍 |
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ChemBio3D的基本使用 |
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12 | 2 | 面授 | 计算化学简介 |
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8 | 13 | 2 | 线上 | Origin软件简介 |
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Origin基本界面 |
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14 | 2 | 线上 | Origin的使用-1 |
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9 | 15 | 2 | 线上 | Origin的使用-2 |
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16 | 2 | 面授 | 科技作图基本要求 |
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10 | 17 | 2 | 面授 | 核磁谱图软件ACD |
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XRD谱图软件Search-Match |
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18 | 2 | 面授 | 综合讲解 |
具备一定计算机基础与专业英语知识。
推荐教材:
1. 《化学信息学》(第三版),邵学广,蔡文生 著 (普通高等教育“十二五”规划教材·名校名师系列.科学出版社) 2013年3月
参考书:
[1] 《化学信息学》(第三版),邵学广,蔡文生 著 (普通高等教育“十二五”规划教材·名校名师系列.科学出版社) 2013年3月
[2] 《化学信息学教程——国外优秀化学著作译丛》,中国化工信息中心-北京中化信深达信息技术有限责任公司-化学工业出版社,化学工业出版社,2004年。
[3] 《化学文献及查阅方法》(第三版),余向春 编著,科学出版社,2003年。
[4] 《精通ChemDraw》,胡立江 编著,清华大学出版社,2002年。
[5] 《ChemOffice2008实用教程》,曾炜,孙延辉,李红霞 编著,化学工业出版社,2009年。
[6] 《Origin实用教程》(7.5版),周剑平 编著,西安交通大学出版社,2007年。
[7] 《化学软件及其应用》,李梦龙、王智猛、姜林、刘丽霞 编著,化学工业出版社,2004年。
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